Vai ai contenuti. | Spostati sulla navigazione | Spostati sulla ricerca | Vai al menu | Contatti | Accessibilità

| Crea un account

Ghisi, Margherita (2010) Studio del ruolo dei microRNA nella maturazione e nella leucemogenesi T. [Tesi di dottorato]

Full text disponibile come:

[img]
Anteprima
Documento PDF (tesi di dottorato)
3536Kb

Abstract (inglese)

Maturation of T cells occurs through a series of steps and is driven by factors and mechanisms which remain poorly defined. Recent work shows that some microRNAs (miRs) are dynamically regulated in their expression during hematopoietic development, inflammation and leukemogenesis. However, little is known regarding the possible role of miRs during the physiologic development of human T cells or their significance in T cell-derived malignancies. In order to identify miRs which could be involved in the differentiation of T lymphocytes, we analyzed the expression profile of miRs in human T cell progenitors at different stages of maturation: Double Positive (DP; CD4+CD8+), Single Positive CD4+ (SP CD4; CD4+CD8-) and Single Positive CD8+ (SP CD8, CD4-CD8+). In parallel, in order to deepen our knowledge about microRNA expression in T lymphoid cells, smallRNA libraries were generated from total RNA of unsorted thymocytes, DP thymocytes, CD4+ and CD8+ mature peripheral blood lymphocytes. The array-based analysis showed that each thymic population displays a distinct miR expression profile, which reflected the developmental relationships between maturation stages in thymocytes. A general up-regulation of miR expression was observed in T precursors during the maturation from DP to SP stage.
The generation of small-RNA libraries enabled us to study the expression of both known and new candidate miRs in different T lymphoid populations. In order to identify known and new candidate miRNAs among the short-RNA sequences, a computational pipeline was developed. Computational analysis of the 29.744 small-RNA sequences obtained from our libraries led to the identification of 139 sequences corresponding to known miRs and 98 sequences of new candidate miRs. A bootstrap analysis estimated that the sequence data covered more than 80% of the total content of miRs in the 4 libraries. The analysis of the libraries confirmed the general up-regulation of miR expression during T cell maturation. By comparing the array and sequence data, we identified a group of known miRs which were consistently regulated during normal T cell maturation. The modulation of the expression during T cell differentiation of some of these miR, such as miR-150, was further validated by qRT-PCR. Subsequently, for this subset of miR, we searched for potential target genes by crossing the results of 3 different target prediction softwares (Miranda, TargetScan and PicTar). Among the predicted targets for this group of miRs we found many genes involved in biologically relevant processes, including cell cycle regulation, apoptosis, differentiation and tumorigenesis.
Moreover, we compared the gene expression profiles from thymic subpopulations with the list of computationally predicted targets for the most significantly regulated miRs between mature SP and DP thymocytes. By combining this approach to the pure bioinformatic approach, we identified a gene of the family of Notch receptors (Notch3), referred to as Candidate Target 1, which is known to be important in T cell differentiation and in leukemic transformation and which is concordantly predicted by 3 different target prediction softwares as a target of miR-150, one of the top up-regulated miR during T cell maturation from DP to SP stage. Moreover, Candidate Target 1 is regulated in thymocytes maturation in the opposite direction compared to miR-150. In particular, we identified a high complementarity between miR-150 and the 3’UTR of Candidate Target 1. We are now working in order to validate experimentally the association between miR-150 and Candidate Target 1.
In parallel, we decided to study the functional effects of miR-150 over-expression in T-ALL cell lines. MiR-150 is expressed at very low levels in all the T-ALL cell lines tested. Interestingly, when we forced the expression of miR-150 in Jurkat T-ALL cells, we observed a significant reduction of the proliferation rate associated with the accumulation of cells in the G2 phase of cell cycle.
Eventually, in order to identify patterns of miR expression that can be associated with malignant transformation, we compared the miR expression profiles of human thymocyte subpopulations to the profile of a group of T-cell lymphoblastic lymphomas (T-LBL) of childhood and to that of a group of reactive non-neoplastic lymph nodes (LN) (provided by Dr. Rosolen laboratory, Department of Pediatrics, University of Padova). The hierarchical clustering of the samples indicated that TLBLs have a group of miRs which are differentially expressed both in respect to reactive lymph nodes and to thymic healthy subsets. Interestingly, we observed that all the top 25 differentially regulated miRs during T differentiation from DP to SP stage (excluding miR-128) show a significant differential expression in T-LBL compared to at least one of the thymus populations. In the future, we plan to investigate the biological significance of some of the miRs regulated in the maturation and neoplastic transformation of T cells, playing particular attention to miR-150 role in these processes.

Abstract (italiano)

La maturazione delle cellule T avviene attraverso una serie di complesse modificazioni fenotipiche e genotipiche ed è guidata da fattori e meccanismi in parte ancora poco compresi. Recenti lavori hanno mostrato che l'espressione di alcuni microRNA (miR) è dinamicamente regolata nel corso dello sviluppo ematopoietico, della risposta immunitaria e della leucemogenesi. Tuttavia, attualmente, è ancora in gran parte sconosciuto il ruolo dei miR nello sviluppo fisiologico delle cellule T, nonché il significato della loro alterata espressione nella leucemogenesi T. Allo scopo di identificare miR potenzialmente coinvolti nella differenziazione dei linfociti T, abbiamo analizzato il profilo d’espressione dei miR in timociti umani a diversi stadi di maturazione: Doppi Positivi (DP; CD4+CD8+), Singoli Positivi CD4+ (SP CD4; CD4+CD8-) e Singoli Positivi CD8+ (SP CD8, CD4-CD8+). Parallelamente, al fine di approfondire la nostra conoscenza sull’espressione dei miR nelle popolazioni linfoidi T, abbiamo generato delle librerie di small-RNA a partire dall’RNA totale di timociti non frazionati, timociti DP, linfociti maturi CD4+ e CD8+ del sangue periferico.
L’analisi dei dati degli array ha mostrato che ogni popolazione timica presenta un profilo d’espressione dei miR caratteristico e distinto, che riflette le relazioni fra gli stadi di sviluppo dei precursori T. Nel corso della maturazione dei precursori T dallo stadio DP a quello SP si osserva una generale up-regolazione dell’espressione dei miR.
La generazione delle librerie di small-RNA ci ha permesso di studiare l’espressione sia dei miR noti, che di nuovi candidati miR nelle diverse popolazioni linfoidi T. Al fine di identificare i miR noti e nuovi potenziali fra le sequenze delle librerie di small-RNA, è stata sviluppata una pipeline bioinformatica. L’analisi computazionale delle 29.744 sequenze di small-RNA ricavate dalle nostre librerie ha portato all’identificazione di 139 sequenze corrispondenti a miR noti e 98 sequenze di candidati nuovi miR. Mediante un'analisi bootstrap, è stato calcolato che, per tutte e 4 le librerie, il set di miR maturi sequenziati rappresenta più dell'80% della totalità dei miR che si stima siano espressi nei campioni. L’analisi delle librerie ha confermato la generale up-regolazione dell’espressione dei miR nel corso della maturazione delle cellule T. Comparando i dati degli array e del sequenziamento delle librerie, è stato individuato un gruppo di miR noti che sono consistentemente regolati durante la differenziazione T. Il pattern di espressione nei diversi stadi di sviluppo T di alcuni di questi miR, tra cui miR-150, è stato validato mediante qRT-PCR. In seguito, abbiamo fatto una ricerca dei target potenziali di questi miR integrando i risultati di 3 diversi software di predizione di target (Miranda, TargetScan and PicTar). Fra i candidati target del gruppo di miR d’interesse sono stati identificati molti geni coinvolti in processi biologici rilevanti, come la regolazione del ciclo cellulare, l’apoptosi, il differenziamento e la tumorigenesi.
Inoltre, abbiamo confrontato i profili di espressione genica delle popolazioni timocitarie con la lista di target predetti computazionalmente per i miR regolati con maggiore fold-change nel corso della differenziazione dei timociti da DP a SP. Combinando quest’ultimo approccio alla ricerca bioinformatica integrata di target, abbiamo identificato un gene della famiglia dei recettori Notch (Notch3), definito Candidate Target 1, che è noto giocare un ruolo importante nella differenziazione T e nella trasformazione leucemica e che viene predetto, in modo concorde da tre diversi software di predizione di target, come bersaglio di miR-150, uno dei miR maggiormente up-regolati nelle popolazioni timocitarie mature rispetto ai DP. Inoltre, il trascritto di Candidate Target 1 risulta regolato in modo opposto al miR-150 nel passaggio dei timociti dallo stadio DP a quello di SP CD4. In particolare, abbiamo identificato un'elevata complementarietà fra il miR-150 e l'UTR-3' del gene Candidate Target 1. Attualmente stiamo lavorando per validare sperimentalemente l’associazione fra miR-150 e Candidate Target 1.
In parallelo, abbiamo deciso di studiare gli effetti funzionali dell’over-espressione di miR-150 in linee cellulari di T-ALL. MiR-150 è espresso a livelli molto bassi in tutte le linee cellulari di T-ALL analizzate. Inducendo l’espressione forzata di miR-150 nella linea di T-ALL Jurkat, abbiamo osservato un significativo rallentamento del tasso di proliferazione cellulare associato ad un accumulo delle cellule in fase G2.
Infine, allo scopo di identificare pattern di espressione dei miR associati alla trasformazione neoplastica T, abbiamo confrontato i profili d’espressione dei miR delle sottopopolazioni timocitarie umane con il proflo di un gruppo di linfomi linfoblastici T (T-LBL) pediatrici ed un gruppo di linfonodi reattivi non neoplastici (LN) (forniti dal laboratorio del Dott. Rosolen, Dipartimento di Pediatria, Università di Padova). Il clustering gerarchico dei campioni ha mostrato che i T-LBL hanno un profilo d’espressione dei miR distinto sia da quello delle sottopopolazioni timocitarie, sia da quello dei linfonodi reattivi. Abbiamo inoltre osservato che tutti i 25 miR maggiormente regolati nel passaggio dei timociti dallo stadio DP a SP (a parte miR-128) risultano espressi in modo differenziale nei T-LBL rispetto ad almeno una delle popolazioni timiche. Nel futuro, ci proponiamo di investigare il significato biologico di alcuni dei miR regolati nella maturazione e la trasformazione neoplastica delle cellule T, ponendo particolare attenzione al ruolo di miR-150 in questi processi.

Statistiche Download - Aggiungi a RefWorks
Tipo di EPrint:Tesi di dottorato
Relatore:Amadori, Alberto
Dottorato (corsi e scuole):Ciclo 22 > Scuole per il 22simo ciclo > ONCOLOGIA E ONCOLOGIA CHIRURGICA
Data di deposito della tesi:NON SPECIFICATO
Anno di Pubblicazione:28 Gennaio 2010
Parole chiave (italiano / inglese):microRNA, T cells, T-leukemia, T-lymphoma
Settori scientifico-disciplinari MIUR:Area 06 - Scienze mediche > MED/06 Oncologia medica
Struttura di riferimento:Dipartimenti > pre 2012 - Dipartimento di Scienze Oncologiche e Chirurgiche
Codice ID:2737
Depositato il:29 Set 2010 11:14
Simple Metadata
Full Metadata
EndNote Format

Bibliografia

I riferimenti della bibliografia possono essere cercati con Cerca la citazione di AIRE, copiando il titolo dell'articolo (o del libro) e la rivista (se presente) nei campi appositi di "Cerca la Citazione di AIRE".
Le url contenute in alcuni riferimenti sono raggiungibili cliccando sul link alla fine della citazione (Vai!) e tramite Google (Ricerca con Google). Il risultato dipende dalla formattazione della citazione.

6. BIBLIOGRAFIA Cerca con Google

1. Abbas AK. Maturazione linfocitaria ed espressione dei geni del recettore per l’antigene. In: Immunologia Cellulare e Molecolare. AK Abbas – AH Lichtman, V ed., Elsevier Italia Srl, Milano, 2006; 7:131-163. Cerca con Google

2. Zlotoff DA, Schwarz BA, Bhandoola A: The long road to the thymus: the generation, mobilization, and circulation of T-cell progenitors in mouse and man. Semin Immunopathol. 2008; 30(4):371-82. Cerca con Google

3. Ladi E, Yin X, Chtanova T, Robey EA. Thymic microenvironments for T cell differentiation and selection. Nat Immunol. 2006; 7(4):338-43. Cerca con Google

4. Iwasaki H, Akashi K. Thymus exclusivity: all the right conditions for T cells. Immunity. 2006; 25(5):697-700. Cerca con Google

5. Wu L. T lineage progenitors: the earliest steps en route to T lymphocytes. Curr Opin Immunol. 2006; 18(2):121-6. Cerca con Google

6. Chi AW, Bell JJ, Zlotoff DA, Bhandoola A. Untangling the T branch of the hematopoiesis tree. Curr Opin Immunol. 2009; 21(2):121-6. Cerca con Google

7. Weerkamp F, Pike-Overzet K, Staal FJ. T-sing progenitors to commit. Trends Immunol. 2006; 27(3):125-31. Cerca con Google

8. Dik WA, Pike-Overzet K, Weerkamp F et al. New insights on human T cell development by quantitative T cell receptor gene rearrangement studies and gene expression profiling. J Exp Med. 2005; 201(11):1715-23. Cerca con Google

9. Mueller DL. Mechanisms maintaining peripheral tolerance. Nat Immunol. 2010; 11(1):21-7. Cerca con Google

10. Klein L, Hinterberger M, Wirnsberger G, Kyewski B. Antigen presentation in the thymus for positive selection and central tolerance induction. Nat Rev Immunol. 2009; 9(12):833-44. Cerca con Google

11. Schnell S, Demolliere C, van den Berk P, Kirberg J, Jacobs H. Constitutive expression of the pre-TCR enables development of mature T cells. Int Immunol 2006; 18: 911-20. Cerca con Google

12. Graux C, Cools J, Michaux L, Vandenberghe P, Hagemeijer A. Cytogenetics and molecular genetics of T‑cell acute lymphoblastic leukemia: from thymocyte to lymphoblast. Leukemia 2006; 20:1496–1510. Cerca con Google

13. Aifantis I, Raetz E, Buonamici S. Molecular pathogenesis of T-cell leukaemia and lymphoma. Nat Rev Immunol 2008; 8:380-90. Cerca con Google

14. O’Neil J and Look AT. Mechanisms of transcription factor deregulation in lymphoid cell transformation. Oncogene 2007; 26:6838-6849. Cerca con Google

15. Weng AP, Ferrando AA et al. Activating mutations of NOTCH1 in human T cell acute lymphoblastic leukemia. Science 2004 306:269-71. Cerca con Google

16. Bellavia D, Campese AF, Vacca A, Gulino A, Screpanti I. Notch3, another Notch in T cell development. Semin Immunol. 2003;15(2):107-12. Cerca con Google

17. Koch U, Radtke F. Notch and cancer: a double-edged sword. Cell Mol Life Sci 2007; 64:2746-62. Cerca con Google

18. Weerkamp F, van Dongen JJM and Staal FJT. Notch and Wnt signaling in T-lymphocyte development and acute lymphoblastic leukemia. Leukemia 2006; 20:1197-1205. Cerca con Google

19. Radtke F, Wilson A, Mancini SJ, MacDonald HR. Notch regulation of lymphocyte development and function. Nat Immunol 2004; 5:247-53. Cerca con Google

20. Sambandam A, Maillard I et al. Notch signaling controls the generation and differentiation of early T lineage progenitors. Nat Immunol 2005; 6:663-70. Cerca con Google

21. Rothenberg EV. Notchless T cell maturation? Nat Immunol 2001; 2:189-90. Cerca con Google

22. Spits H. Development of alphabeta T cells in the human thymus. Nat Rev Immunol 2002; 2:760-72. Cerca con Google

23. Aster JC. Deregulated Notch signalling in acute T-cell lymphoblastic leukemia/lymphoma: new insights, questions, and opportunities. Int J Hematol 2005; 82(4):295-301. Cerca con Google

24. Bellavia D, Campese AF et al. Constitutive activation of NF-kappaB and T-cell leukemia/lymphoma in Notch3 transgenic mice. EMBO J. 2000; 19(13):3337-48. Cerca con Google

25. Thomas DA and Kantarjian HM. Lymphoblastic lymphoma. In: Advances in the treatment of adult acute lymphocytic leukemia-Part II. Hematology/Oncology Clinics of North America, 2001; 15(1):51-95. Cerca con Google

26. Shomron N, Levy C. MicroRNA-biogenesis and Pre-mRNA splicing crosstalk. J Biomed Biotechnol. 2009; 2009:594678. Cerca con Google

27. Shomron N, Golan D, Hornstein E. An evolutionary perspective of animal microRNAs and their targets. J Biomed Biotechnol. 2009; 2009:594738. Cerca con Google

28. Kim YK, Kim VN. Processing of intronic microRNAs. EMBO J. 2007; 26(3):775-83. Cerca con Google

29. Winter J, Jung S, Keller S, Gregory RI, Diederichs S. Many roads to maturity: microRNA biogenesis pathways and their regulation. Nat Cell Biol. 2009; 11(3):228-34. Cerca con Google

30. Breving K, Esquela-Kerscher A. The complexities of microRNA regulation: mirandering around the rules. Int J Biochem Cell Biol. 2009. [Epub ahead of print] Cerca con Google

31. Grimson A, Farh KK et al. MicroRNA targeting specificity in mammals: determinants beyond seed pairing. Mol Cell. 2007; 27(1):91-105. Cerca con Google

32. Nielsen CB, Shomron N et al. Determinants of targeting by endogenous and exogenous microRNAs and siRNAs. RNA. 2007; 13(11):1894-910. Cerca con Google

33. Janowski BA, Younger ST et al. Activating gene expression in mammalian cells with promoter-targeted duplex RNAs. Nat Chem Biol. 2007; 3(3):166-73. Cerca con Google

34. Li LC, Okino ST et al. Small dsRNAs induce transcriptional activation in human cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2006; 103(46):17337-42. Cerca con Google

35. Baek D, Villén J et al. The impact of microRNAs on protein output. Nature. 2008; 455(7209):64-71. Cerca con Google

36. Selbach M, Schwanhäusser B et al. Widespread changes in protein synthesis induced by microRNAs. Nature. 2008; 455(7209):58-63. Cerca con Google

37. Lawrie CH. MicroRNA and hematology: small molecules, big function. Br.J.Haematol. 2007, 137(6):503-12. Cerca con Google

38. Chen CZ, Li L, Lodish HF, Bartel DP. MicroRNAs modulate hematopoietic lineage differentiation. Science. 2004; 303(5654):83-6. Cerca con Google

39. Ramkissoon SH, Mainwaring LA et al. Hematopoietic-specific microRNA expression in human cells. Leuk Res. 2006; 30(5):643-7. Cerca con Google

40. Georgantas RW 3rd, Hildreth R et al. CD34+ hematopoietic stem-progenitor cell microRNA expression and function: a circuit diagram of differentiation control. Proc Natl Acad Sci U S A. 2007; 104(8):2750-5. Cerca con Google

41. Lu LF, Liston A. MicroRNA in the immune system, microRNA as an immune system. Immunology. 2009; 127(3):291-8. Cerca con Google

42. Muljo SA, Ansel KM et al. Aberrant T cell differentiation in the absence of Dicer. J Exp Med. 2005; 202(2):261-9. Cerca con Google

43. Cobb BS, Nesterova TB et al. T cell lineage choice and differentiation in the absence of the RNase III enzyme Dicer. J Exp Med. 2005; 201(9):1367-73. Cerca con Google

44. Cobb BS, Hertweck A et al. A role for Dicer in immune regulation. J Exp Med. 2006; 203(11):2519-27. Cerca con Google

45. Xiao C, Rajewsky K. MicroRNA control in the immune system: basic principles. Cell. 2009; 136(1):26-36. Cerca con Google

46. Neilson JR, Zheng GX, Burge CB, Sharp PA. Dynamic regulation of miRNA expression in ordered stages of cellular development. Genes Dev. 2007; 21(5):578-89. Cerca con Google

47. Li QJ, Chau J et al. miR-181a is an intrinsic modulator of T cell sensitivity and selection. Cell. 2007; 129(1):147-61. Cerca con Google

48. Liang TJ, Qin CY. The emerging role of microRNAs in immune cell development and differentiation. APMIS. 2009; 117(9):635-43. Cerca con Google

49. Bi Y, Liu G, Yang R. MicroRNAs: novel regulators during the immune response. J Cell Physiol.; 218(3):467-72. Cerca con Google

50. Schickel R, Boyerinas B, Park SM, Peter ME. MicroRNAs: key players in the immune system, differentiation, tumorigenesis and cell death. Oncogene. 2008; 27(45):5959-74. Cerca con Google

51. Vasilatou D, Papageorgiou S et al. The role of microRNAs in normal and malignant hematopoiesis. Eur J Haematol. 2009. [Epub ahead of print] Cerca con Google

52. Zhou B, Wang S et al. miR-150, a microRNA expressed in mature B and T cells, blocks early B cell development when expressed prematurely. Proc Natl Acad Sci U S A. 2007; 104(17):7080-5. Cerca con Google

53. Xiao C, Calado DP et al. MiR-150 controls B cell differentiation by targeting the transcription factor c-Myb. Cell. 2007; 131(1):146-59. Cerca con Google

54. Lu J, Getz G et al. MicroRNA expression profiles classify human cancers. Nature. 2005; 435(7043):834-8. Cerca con Google

55. Calin GA, Croce CM. MicroRNA signatures in human cancers. Nat Rev Cancer. 2006; 6(11):857-66. Cerca con Google

56. Calin GA, Sevignani C et al. Human microRNA genes are frequently located at fragile sites and genomic regions involved in cancers. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004; 101(9):2999-3004. Cerca con Google

57. Hurst DR, Edmonds MD, Welch DR. Metastamir: the field of metastasis-regulatory microRNA is spreading. Cancer Res. 2009; 69(19):7495-8. Cerca con Google

58. Nimmo RA, Slack FJ. An elegant miRror: microRNAs in stem cells, developmental timing and cancer. Chromosoma. 2009; 118(4):405-18. Cerca con Google

59. Fabbri M, Croce CM, Calin GA. MicroRNAs in the ontogeny of leukemias and lymphomas. Leuk Lymphoma. 2009; 50(2):160-70. Cerca con Google

60. Calin GA, Dumitru CD et al. Frequent deletions and down-regulation of micro- RNA genes miR15 and miR16 at 13q14 in chronic lymphocytic leukemia. Proc Natl Acad Sci U S A. 2002; 99(24):15524-9. Cerca con Google

61. Cimmino A, Calin GA et al. MiR-15 and miR-16 induce apoptosis by targeting BCL2. Proc Natl Acad Sci U S A. 2005; 102(39):13944-9. Cerca con Google

62. Calin GA, Cimmino A et al. MiR-15a and miR-16-1 cluster functions in human leukemia. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008; 105(13):5166-71. Cerca con Google

63. Calin GA, Ferracin M et al. A MicroRNA signature associated with prognosis and progression in chronic lymphocytic leukemia. N Engl J Med. 2005; 353(17):1793-801. Cerca con Google

64. Marton S, Garcia MR et al. Small RNAs analysis in CLL reveals a deregulation of miRNA expression and novel miRNA candidates of putative relevance in CLL pathogenesis. Leukemia. 2008; 22(2):330-8. Cerca con Google

65. Yendamuri S, Calin GA. The role of microRNA in human leukemia: a review. Leukemia. 2009; 23(7):1257-63. Cerca con Google

66. Garzon R, Croce CM. MicroRNAs in normal and malignant hematopoiesis. Curr Opin Hematol. 2008; 15(4):352-8. Cerca con Google

67. Roehle A, Hoefig KP et al. MicroRNA signatures characterize diffuse large B-cell lymphomas and follicular lymphomas. Br J Haematol. 2008; 142(5):732-44. Cerca con Google

68. Chen J, Odenike O, Rowley JD. Leukaemogenesis: more than mutant genes. Nat Rev Cancer. 2010; 10(1):23-36. Cerca con Google

69. Bueno MJ, Pérez de Castro I et al. Genetic and epigenetic silencing of microRNA-203 enhances ABL1 and BCR-ABL1 oncogene expression. Cancer Cell. 2008; 13(6):496-506. Cerca con Google

70. Lum AM, Wang BB et al. Retroviral activation of the mir-106a microRNA cistron in T lymphoma. Retrovirology. 2007; 4:5. Cerca con Google

71. Landais S, Landry S, Legault P, Rassart E. Oncogenic potential of the miR-106-363 cluster and its implication in human T-cell leukemia. Cancer Res. 2007; 67(12):5699-707. Cerca con Google

72. Zanette DL, Rivadavia F et al. MiRNA expression profiles in chronic lymphocytic and acute lymphocytic leukemia. Braz J Med Biol Res. 2007; 40(11):1435-40. Cerca con Google

73. Schotte D, Chau JC et al. Identification of new microRNA genes and aberrant microRNA profiles in childhood acute lymphoblastic leukemia. Leukemia. 2009; 23(2):313-22. Cerca con Google

74. Sonoki T, Iwanaga E, Mitsuya H, Asou N. Insertion of microRNA-125b-1, a human homologue of lin-4, into a rearranged immunoglobulin heavy chain gene locus in a patient with precursor B-cell acute lymphoblastic leukemia. Leukemia. 2005; 19(11):2009-10. Cerca con Google

75. Mi S, Lu J et al. MicroRNA expression signatures accurately discriminate acute lymphoblastic leukemia from acute myeloid leukemia. Proc Natl Acad Sci U S A. 2007; 104(50):19971-6. Cerca con Google

76. Li Z, Luo RT et al. Consistent deregulation of gene expression between human and murine MLL rearrangement leukemias. Cancer Res. 2009; 69(3):1109-16. Cerca con Google

77. Indraccolo S, Tisato V et al. Establishment and characterization of xenografts and cancer cell cultures derived from BRCA1 -/- epithelial ovarian cancers. Eur J Cancer. 2006; 42(10):1475-83. Cerca con Google

78. Leamon J.H., Braverman M.S and Rothberg J.M. High throughput, massively parallel DNA sequencing technology for the era of personalized medicine. Gene therapy and regulation 2007; 3(1):15-31. Cerca con Google

79. Indraccolo S, Habeler W et al. Gene transfer in ovarian cancer cells: a comparison between retroviral and lentiviral vectors. Cancer Res. 2002; 62(21):6099-107. Cerca con Google

80. Harrell, F. E. Regression modeling strategies: with applications to linear models, logistic regression, and survival analysis. Springer, New York, 2001. Cerca con Google

81. Hinkley, A. C. D. a. D. V. Bootstrap Methods and their Applications. Cambridge University Press, New York, 1997. Cerca con Google

82. Landgraf P, Rusu M et al. A mammalian microRNA expression atlas based on small-RNA library sequencing. Cell 2007; 129(7): 1401-14. Cerca con Google

83. Basso K, Sumazin P et al. Identification of the human B cell miRNome. Immunity 2009; 30(5):744-52. Cerca con Google

84. Mazière P, Enright AJ. et al. Prediction of microRNA targets. Drug Discov Today 2007; 12(11-12):452-8. Cerca con Google

85. Farh KK, Grimson A et al. The widespread impact of mammalian microRNAs on mRNA repression and evolution. Science 2005; 310(5755): 1817-21. Cerca con Google

86. Lim LP, Lau NC et al. Microarray analysis shows that some microRNAs down-regulate large numbers of target mRNAs. Nature 2005; 433(7027): 769-73. Cerca con Google

87. Nicolas FE, Pais H et al. Experimental identification of microRNA-140 targets by silencing and over-expressing miR-140. RNA 2008; 14(12): 2513-20. Cerca con Google

88. Li SS, Yu SL et al. Target identification of microRNAs expressed highly in human embryonic stem cells. J Cell Biochem 2009; 106(6): 1020-30. Cerca con Google

89. Wu H, Neilson JR et al. MiRNA profiling of naive, effector and memory CD8 T cells. PLoS One 2007; 2(10):e1020. Cerca con Google

90. Badiani PA, Kioussis D et al. T-cell lymphomas in v-Myb transgenic mice. Oncogene. 1996; 13(10):2205-12. Cerca con Google

91. Lahortiga I, De Keersmaecker K et al. Duplication of the MYB oncogene in T cell acute lymphoblastic leukemia. Nat Genet 2007; 39(5):593-5. Cerca con Google

Download statistics

Solo per lo Staff dell Archivio: Modifica questo record