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Mina, Marco (2013) Mining Biological Networks. [Tesi di dottorato]

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Abstract (inglese)

This thesis addresses relevant issues related to the analysis of biological networks. Path redundancy was exploited to denoise currently available data, dominated by high levels of wrong or missing information, and applied to the local alignment of protein-protein interaction networks. On another research direction, regulatory networks were employed to explain master regulators’ ability of modulating cells’ behaviour. In this direction, an existing approach was adapted for the analysis of miRNAs’ role in Glioblastoma Multiforme cancer cells. The methodological aspects of this work represent an improvement of the foundamental elements of network analysis techniques.

Abstract (italiano)

In questa tesi sono stati affrontati alcuni aspetti problematici legati all’analisi di reti biologiche. Concentrandosi sull’allineamento di reti di interazione proteica, è stato studiato l’uso di metodi basati sul ”path redundancy“ per filtrare il rumore attualmente presente nei dati. In una seconda direzione di ricerca le reti di regolazione sono state sfruttate per spiegare la capacità dei ”master regulators“ di modulare il comportamento delle cellule, adattando di una pipeline d’analisi allo studio degli effetti dei miRNA nel Glioblastoma Multiforme. I progressi metodologici introdotti in questo lavoro contengono potenziali miglioramenti ad alcuni elementi comuni ad altre tecniche di analisi di reti.

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Tipo di EPrint:Tesi di dottorato
Relatore:Toffolo, Gianna
Correlatore:Guerra, Concettina
Dottorato (corsi e scuole):Ciclo 25 > Scuole 25 > INGEGNERIA DELL'INFORMAZIONE > SCIENZA E TECNOLOGIA DELL'INFORMAZIONE
Data di deposito della tesi:28 Gennaio 2013
Anno di Pubblicazione:28 Gennaio 2013
Parole chiave (italiano / inglese):biological network reti biologiche mining
Settori scientifico-disciplinari MIUR:Area 01 - Scienze matematiche e informatiche > INF/01 Informatica
Struttura di riferimento:Dipartimenti > Dipartimento di Ingegneria dell'Informazione
Codice ID:5481
Depositato il:22 Mag 2015 15:00
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