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PDF Document (PhD Thesis)

Abstract (english)

Recently the development of Patient-specific models (PSMs) tailored to patient-specific data, has gained more and more attention in clinical applications. PSMs could represent a solution to the growing awareness of personalized medicine which allow the realization of more effective rehabilitation treatments designed on the subject capabilities. PSMs have the potential of improving diagnosis and optimizing clinical treatments by predicting and comparing the outcomes of different approaches of intervention. Furthermore they can provide information that cannot be directly measured, such as muscle forces or internal stresses and strains of the bones.
Given the considerable amount of diseases affecting motor ability, PSMs of the lower limbs have been broadly addressed in literature. Two techniques are mostly used in this area: musculoskeletal (MS) modeling and finite element (FE) analysis.
(MS) models represent a valuable tool, as they can provide important information about the unique anatomical and functional characteristics of different subjects, through the computation of human internal variables, such as muscle activations and forces and joint contact forces.
The flexibility and adaptability of FE analysis makes it a perfect solution to model biological geometries and materials and to simulate complicated boundary and loading conditions. Accurate and descriptive FE models would serve as an excellent tool for scientific and medical research. Furthermore they could be used in clinical settings if combined with medical imaging, in order to improve patient care.
Several 3-dimensional (3D) foot FE models were recently developed to analyze the biomechanical behavior of the human foot and ankle complex that is commonly studied with experimental techniques like stereophotogrammetry, force and plantar pressure plates.
In this context, many gait analysis protocols have been proposed to assess the 3D kinetics, kinematics and plantar pressure distribution. This evaluation has shown to be useful in characterizing the foot biomechanics in different pathologies like the diabetic foot.
Diabetic foot is an invalidating complication of diabetes mellitus, a chronic disease frequently encountered in the aging population. It is characterize by the development of ulcers which can lead to amputation.
Models for simulations of deformations and stresses in the diabetic plantar pad are required to predict high risk areas on the plantar surface and can be used to investigate the performance of different insoles design for optimal pressure relief.
This work represents a first effort towards the definition of a more complete PSM which combining both a MS model and a FE model, can increase the understanding of the diabetic foot pathology. To achieve this objective, several limitations and issues have been addressed.
As first, MS models of diabetic and control subjects were developed using OpenSim, to estimate muscle forces. The objective was to evaluate whether the diabetic population exhibit lower limb muscle strength deficits compared to the healthy one. Subjects routine gait analysis was performed and lower limb joints kinematics, kinetics, time and space parameters estimated by means of a modified version of the IORgait protocol. 3D lower limb joints kinematics and kinetics was also calculated with OpenSim. Both methodologies were able to highlight differences in joint kinematics and kinetics between the two populations. Furthermore MS models showed significant differences in healthy muscle forces with respect to the diabetic ones, in some of the muscles. This knowledge can help the planning of specific training in order to improve gait speed, balance, muscle strength and joint mobility.

After the use of MS models proved to be applicable in the diabetic population, the next step was to combine them with foot FE models. This was done in two phases.
At first the impact of applying the foot joints contact forces (JCFs) obtained from MS models as boundary condition on the foot FE models was verified. Subject specific geometries from MRI were used for the development of the foot FE models while the experimental plantar pressures acquired during gait were used in the validation process. A better agreement was found between experimentally measured and simulated plantar pressure obtained with JCFs than with the experimentally measured ground reaction forces as boundary conditions.
Afterwards the use of muscles forces as boundary condition in the FE simulations was evaluated. Subject-specific integrated and synchronized kinematic-kinetic data acquired during gait analysis were used for the development of the MS models and for the computation of the muscle forces. Muscle insertions were then located in the MRI and correspondent connectors were created in the FE model.
FE subject-specific simulations were subsequently run with Abaqus by conducting a quasi-static analysis on 4 gait cycle phases and adopting 2 conditions: one including the muscle forces and one without. Once again the validation of the FE simulations was done by means of a comparison between simulated and experimentally measured plantar pressures. Results showed a marked improvement in the estimation of the peak pressure for the model that included the muscles.
Finally, an attempt towards the definition of a parametric foot finite element model was done. In fact, despite the recent developments, patient-specific models are not yet successfully applied in a clinical setting. One of the challenges is the time required for mesh creation, which is difficult to automate. The development of parametric models by means of the Principle Component Analysis (PCA) can represent an appealing solution. In this study PCA was applied to the feet of a small cohort of diabetic and healthy subjects in order to evaluate the possibility of developing parametric foot models and to use them to identify variations and similarities between the two populations.
The limitations of the use of models have also been analyzed. Their adoption is indeed limited by the lack of verification and validation standards. Even using subjects’ MRI or CT data for the development of FEM together with experimentally acquired motion analysis data for the boundary and loading conditions, the subject specifity is still not reached for what regards all the material properties. Furthermore it should be considered that everything relies on algorithm and models that would never be perfectly representing the reality.
Overall, the work presented in this thesis represents an extended evaluation of the possible uses of modeling techniques in the diabetic foot prevention, by considering all the limitations introduced as well as the potential benefits of their use in a clinical context. The research is organized in six chapters:
Chapter 1 - provides a background on the modeling techniques, both FE modeling and MS modeling. Furthermore it also describes the gait analysis, its instrumentation and some of the protocols used in the evaluation of the biomechanics of the lower limbs;
Chapter 2 - gives a detailed overview of the biomechanics of the foot. It particularly focuses on the diabetes and the diabetic foot;
Chapter 3 - introduces the application of MSs for the diabetic foot prevention after a brief background on the techniques usually chosen for the evaluation of the motor impairments caused by the disease. Aim, material and methods, results and discussion are presented. The complete work flow is described, and the chapter ends with a discussion on new key findings and limitations.
Chapter 4 – reports the work done to combine the use of musculoskeletal models with foot FEMs. At first the impact of applying the foot joints contact forces obtained from MS models as boundary condition on the foot FEMs is verified. Then the use of muscles forces (again obtained from MS models) as boundary condition in the FE simulations is evaluated. For both studies a brief background is presented together with the methods applied, the results obtained and a discussion of novelties and drawbacks.
Chapter 5 – explores the possibility of defining a parametric foot FEM applying the Principle Component Analysis (PCA) on the feet of a small cohort of diabetic and healthy subjects. A background on the importance of patient specific models is presented followed by material and methods, results and discussion of what obtained with this study.
Chapter 6 - summarizes the results and the novelty of the thesis, delineating the conclusions and the future research paths.

Abstract (italian)

Recentemente lo sviluppo di modelli specifici di un paziente (PSM), cioè creati a partire dai suoi dati, ha guadagnato sempre più attenzione per le possibili applicazioni cliniche. Questi modelli potrebbero, infatti, rappresentare una soluzione alla crescente consapevolezza che la medicina deve essere personalizzata al fine di ottenere un trattamento riabilitativo più efficace e disegnato ad hoc sulle capacità soggetto. Gli PSM hanno il potenziale di migliorare la diagnosi e di ottimizzare la terapia riabilitativa, data la loro capacità di prevedere e di confrontare i risultati di diversi approcci d’intervento. Inoltre essi sono in grado di fornire informazioni che non possono essere direttamente misurate, quali forze muscolari o tensioni interne alle ossa. Data la notevole quantità di malattie che causano deficit motori, gli PSM sono stati ampiamente affrontati in letteratura. Le due tecniche per lo più utilizzate in questo settore sono la modellazione muscoloscheletrica (MS) e la modellazione agli elementi finiti (FE).
I modelli MS rappresentano uno strumento prezioso, poiché possono fornire importanti informazioni sulle caratteristiche anatomiche e funzionali dei diversi soggetti, attraverso il calcolo di variabili interne come attivazioni muscolari e forze di contatto alle articolazioni.
La flessibilità e l'adattabilità dell'analisi FE la rende una soluzione ideale per modellare geometrie e materiali biologici e per simulare condizioni al contorno e di carico complicate. Modelli FE (FEM) precisi e descrittivi potrebbero dimostrarsi un ottimo strumento per la ricerca scientifica e medica. Inoltre, potrebbero essere utilizzati in ambito clinico se combinati con l'imaging medico, al fine di migliorare la cura del paziente.
Diversi FEM a 3 dimensioni (3D) del piede sono stati recentemente sviluppati per analizzare il comportamento biomeccanico del complesso piede-caviglia che è comunemente studiato con tecniche sperimentali come la stereofotogrammetria, le piattaforme di forza e di pressione.
In questo contesto, sono stati proposti molti protocolli per l'analisi del cammino al fine di valutare la cinematica, la cinetica e la distribuzione della pressione plantare in 3D. Questa valutazione si è dimostrata utile per caratterizzare la biomeccanica del piede in diverse patologie come il piede diabetico.
Il piede diabetico è una complicanza invalidante del diabete mellito, una malattia cronica sempre più frequente nella popolazione anziana. Esso è caratterizzato dallo sviluppo di ulcere che possono portare all'amputazione. Modelli per la simulazione di deformazioni e sollecitazioni nel tessuto plantare diabetico devono essere in grado di prevedere quali sono le zone ad alto rischio per la formazione di ulcere sulla superficie plantare e possono essere usati per studiare le prestazioni di diverse solette nell'alleviare la pressione.
Questo lavoro rappresenta un primo sforzo verso lo sviluppo di uno PSM più completo che combinando un modello MS a un FEM, può aumentare la comprensione della patologia del piede diabetico. Per raggiungere quest’obiettivo, numerose limitazioni e problematiche sono state analizzate e risolte.
Innanzitutto, modelli MS di soggetti sani e diabetici sono stati sviluppati usando OpenSim al fine di stimare le forze muscolari. L'obiettivo era di valutare se la popolazione malata presenta deficit di forza muscolare negli arti inferiori rispetto a quella sana. I soggetti sono stati sottoposti a un'analisi del cammino e la cinematica e la cinetica degli arti inferiori sono state stimate per mezzo di una versione modificata del protocollo IORgait. La cinematica e la cinetica 3D delle articolazioni degli arti inferiori sono state calcolate anche con OpenSim. Entrambe le metodologie sono state in grado di evidenziare alcune differenze di cinematica e cinetica articolare tra le due popolazioni. I modelli MS hanno inoltre evidenziato differenze nelle forze muscolari dei soggetti sani rispetto a quelli diabetici. Questa conoscenza può aiutare nella pianificazione di terapie riabilitative specifiche per i pazienti diabetici al fine di migliorare la velocità, l'equilibrio, la forza muscolare, l’andatura e la mobilità articolare.
Dopo aver dimostrato l'applicabilità dei modelli MS nella popolazione diabetica, il passo successivo è stato quello di combinarli con FEM del piede. Ciò è stato fatto in due fasi. In un primo momento l'impatto dell'applicazione delle forze di reazione dell'articolazione del piede, ottenute dai modelli MS, come condizione al contorno per modelli FE del piede è stata verificata. Le geometrie specifiche del soggetto, ricavate da MRI, sono state utilizzate per lo sviluppo dei FEM del piede mentre le pressioni plantari sperimentalmente acquisite durante la deambulazione sono state utilizzate nel processo di validazione. Un miglior accordo tra pressione misurata sperimentalmente e pressione simulata è stato ottenuto utilizzando, come condizioni al contorno, le forze di reazione alla caviglia rispetto alle forze di reazione del suolo sperimentalmente simulate.
Dopodiché l'uso di forze muscolari come condizione al contorno nelle simulazioni FE è stata valutata. Dati di cinematica e cinetica acquisiti in sincrono durante l'analisi del cammino sono stati utilizzati per lo sviluppo di modelli MS e per il calcolo delle forze muscolari. Le inserzioni muscolari sono state poi trovate nelle immagini di risonanza magnetica e i connettori corrispondenti sono stati creati nel FEM. Le simulazioni FE specifiche del soggetto sono state in seguito eseguite con il software Abaqus conducendo un'analisi quasi statica su quattro fasi del ciclo del passo e adottando due condizioni di carico: una che comprendeva le forze muscolari e una senza. Ancora una volta la validazione delle simulazioni FE è stata fatta per mezzo di un confronto tra le pressioni plantari simulate e misurate sperimentalmente. I risultati hanno mostrato un miglioramento marcato nella stima del picco di pressione nel modello che includeva i muscoli.
Infine è stato fatto un tentativo per la definizione di un modello agli elementi finiti del piede parametrico. Infatti, nonostante i recenti sviluppi, gli PSM non sono ancora stati applicati con successo in un ambiente clinico. Una delle possibili spiegazioni è il tempo necessario per la creazione della mesh, operazione che è di difficile automatizzazione. Lo sviluppo di modelli parametrici mediante l'analisi in componenti principali (PCA) può rappresentare una soluzione accattivante. In questo studio la PCA è stata applicata alla geometria dei piedi di una piccola coorte di soggetti diabetici e sani per valutare la possibilità di sviluppare modelli parametrici del piede e di utilizzarli per identificare varianti e analogie tra le due popolazioni.
Anche i limiti imposti dall'uso di modelli sono stati analizzati. La loro adozione è, infatti, limitata dalla mancanza di standard di verifica e validazione. Anche utilizzando l'MRI per lo sviluppo di un FEM, e dati sperimentali di analisi del movimento per le condizioni al contorno e di carico, la specificità del soggetto non è mai perfettamente raggiunta ad esempio per quanto riguarda le proprietà dei materiali. Inoltre bisognerebbe considerare che tutto si appoggia su algoritmi e modelli che non saranno mai in grado di rappresentare perfettamente la realtà.
Nel complesso, il lavoro presentato in questa tesi rappresenta una valutazione estesa dei possibili usi di tecniche di modellazione nella prevenzione del piede diabetico, considerando tutte le limitazioni introdotte e i potenziali vantaggi del loro utilizzo in un contesto clinico. La ricerca si articola in sei capitoli:
Capitolo 1 - fornisce uno sguardo generale sulle tecniche di modellazione, sia modellazione agli elementi finiti sia modellazione muscoloscheletrica. Inoltre descrive l'analisi del cammino, la strumentazione richiesta e i protocolli sviluppati per l'analisi degli arti inferiori.
Capitolo 2 - fornisce una panoramica dettagliata della biomeccanica del piede concentrandosi in particolare sul diabete e il piede diabetico;
Capitolo 3 - introduce l'applicazione dei modelli MS per la prevenzione del piede diabetico dopo una breve introduzione sulle tecniche più comuni utilizzate nella valutazione dei deficit motori causati dalla malattia. Obiettivi, materiali e metodi, risultati e discussione finale sono presentati. Il flusso di lavoro completo è descritto, e il capitolo si finisce con una discussione sulle nuove scoperte e sulle limitazioni.
Capitolo 4 - riporta il lavoro fatto per combinare l'uso di modelli muscoloscheletrici con FEM del piede. In un primo momento è verificato l'impatto dell'applicazione delle forze di contatto all'articolazione del piede, ottenute dai modelli MS, come condizione al contorno nei FEM del piede. Di seguito è valutato l'uso delle forze muscolari (ancora una volta ottenute dai modelli MS) come condizione al contorno nelle simulazioni FE. Per entrambi gli studi è presentata una breve introduzione insieme ai metodi applicati, ai risultati ottenuti e a una discussione sulle novità introdotte e sui limiti.
Capitolo 5 - esplora la possibilità di definire un FEM del piede parametrico applicando l' analisi delle componenti principali (PCA) ai piedi di una piccola coorte di soggetti diabetici e sani. Una panoramica sull'importanza di modelli specifici dei pazienti è presentata seguita da materiali e metodi, risultati e discussione di ciò che è stato ottenuto con questo studio.
Capitolo 6 - riassume i risultati e la novità della tesi, delineando le conclusioni e i percorsi di ricerca futuri.

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EPrint type:Ph.D. thesis
Tutor:Cobelli, Claudio
Supervisor:Sawacha, Zimi
Data di deposito della tesi:01 February 2016
Anno di Pubblicazione:31 January 2016
Key Words:diabetes, musculoskeletal modeling, finit element modeling, diabetic foot, biomechanics, gait analysis
Settori scientifico-disciplinari MIUR:Area 09 - Ingegneria industriale e dell'informazione > ING-INF/06 Bioingegneria elettronica e informatica
Struttura di riferimento:Dipartimenti > Dipartimento di Ingegneria dell'Informazione
Codice ID:9532
Depositato il:24 Oct 2016 16:50
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